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一個細胞中含有多少DNA

作者:新景實驗室
版權(quán)說明:本文系原創(chuàng)文章 轉(zhuǎn)載請標(biāo)注出處和本文鏈接

選用“一個細胞含有多少DNA作為題目時,小編糾結(jié)了好久,因為這個問題問得實在不夠?qū)I(yè),不同生物細胞中的DNA含量是由其基因組DNA的長度決定的--更糟糕的是,病毒沒有細胞結(jié)構(gòu),還不能作為“細胞”囊括進去。因此最精確的問題應(yīng)當(dāng)是:“構(gòu)成一個生物樣本的最小單元含有多少核酸”,但是這個題目的吸引力肯定會大打折扣。退而求次,畢竟選擇提問“一個細胞含有多少DNA”的同學(xué),更可能會問“試劑盒一次能提多少DNA”。

針對“試劑盒一次能提多少DNA”這個問題,其實進一步的需要思考的是“生物樣本中含有多少DNA”,然后我們自然開始追問,構(gòu)成樣本的每個最小的單元(細胞,細菌或病毒)含有多少DNA。

我們以人類為例來計算一個人類細胞中含有多少DNA

從百度搜索可知以下數(shù)據(jù):

1. 人類基因組DNA約為3×109 bp,且為二倍體基因組,故一個人類細胞中含有6×109 bp的基因組DNA。

2. 已知1.5pmol1000bpDNA分子質(zhì)量1μg。

3. 1g=1000mg=106μg=109ng=1012pg

4. 1mol=1000mmol=106μmol=109nmol=1012pmol,則1.5pmol=1.5×10-12mol

那么可計算得

1.5pmol=1.5×10-12×6.02×1023=9.03×1011

    1000bp×9.03×1011=1bp×9.03×1014=1μg

    1個人類細胞所含的DNA質(zhì)量為:

6×109bp/9.03×1014=6.64×10-6μg

至此,計算公式可以簡化為:

某物種單個細胞(或結(jié)構(gòu)單元)的DNA含量=(某物種基因組DNA堿基數(shù)×倍體數(shù)/9.03×1014μg

反過來:

提取1μg 某物種的DNA所需要的細胞數(shù)量= 9.03×1014/(某物種基因組DNA堿基數(shù)×倍體數(shù)),那么要從人類培養(yǎng)細胞中提取到1μg DNA,至少需要1.51×105細胞。

注意:

1. 真核生物實際所需的細胞數(shù)可能會比算出來的少一些,因為真核細胞中的線粒體、葉綠體也能貢獻DNA。當(dāng)然,由于提取效率不可能達到100%,算出來所需的細胞數(shù)還是差不多的。

2. 有的生物只有一套基因組,為一倍體,如細菌等;有的含兩套多套基因組,為二倍體,如人類;還有的含有多套基因組,為多倍體,如四倍體水稻、三倍體水稻等。

 

算到這兒,小編決定隆重推出simgen常數(shù):simgen=9.03×1014,同學(xué)們只要牢記simgen常數(shù)9.03×1014,算起來好輕松哦。

讓我們一起看下用simgen常數(shù)算出來的,獲得不同物種1μg DNA需要多少個細胞/病毒數(shù)吧:

物種名稱

基因組大?。?span >bp

倍體數(shù)

個細胞(病毒數(shù))/μg DNA

3,000,000,000

2

1.51×105

小鼠

2,716,965,481

2

1.66×105

大鼠

2,800,000,000

2

1.62×105

2,389,078,169

2

1.89×105

大腸桿菌

4,000,000

1

2.25×108

酵母

20,000,000

1

4.52×107

λ 噬菌體

50,000

1

1.81×1010

乙肝病毒

3,200

1

2.82×1011

水稻

466,000,000

2

9.7×105

N

1.94×106/N

玉米

2,500,000,000

2

1.81×105

N

3.61×105/N

斑馬魚

1,700,000,000

2

2.66×105

河豚

500,000,000

2

9.10×105

當(dāng)我們可以預(yù)判樣本中的DNA含量時,就可以更科學(xué)選擇合適的DNA提取方法了:

1. 當(dāng)樣本中的DNA含量大于50 μg 以上時,通常小量制備的核酸純化柱已經(jīng)超載了(比如產(chǎn)生堵柱子的現(xiàn)象),應(yīng)選用中大量DNA提取試劑盒,或者是選用經(jīng)典的酚氯仿抽提,異丙醇沉淀DNA;

2. 當(dāng)樣本中的DNA含量介于1-30 μg時,推薦選用試劑盒提取DNA。用酚氯仿抽提,異丙醇沉淀法可能會觀察不到DNA沉淀;

3. 當(dāng)樣本中的DNA含量小于1 μg時,酚氯仿抽提,異丙醇沉淀法幾乎失效,挽救的方法是添加Carrier RNASimgenCat.4003101)或是糖元協(xié)助DNA共同沉淀;更簡單的方案是購買Simgen 微量DNA提取試劑盒(Cat.3102050);

4. 當(dāng)樣本中的DNA含量小于1ng時,請先按方案3嘗試;如果還不行,請撥打400-0099-857獲取幫助吧。

 

 新景生物實驗室

                                                          20161123