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從火龍果中提取RNA

作者:新景實(shí)驗(yàn)室
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一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?/span>

從火龍果果肉中提取RNA

二、實(shí)驗(yàn)材料:

新鮮的火龍果、研缽、植物果肉總RNA試劑盒(Simgen,Cat.No.5102050)、植物總RNA提取試劑盒(Simgen,Cat.No.5101050。

三、實(shí)驗(yàn)方法:

本次實(shí)驗(yàn)嘗試用Simgen的植物果肉總RNA試劑盒和植物總RNA提取試劑盒兩種方法來(lái)提取RNA。

四、實(shí)驗(yàn)步驟:

植物果肉總RNA試劑盒提取步驟:

1. 1.5 ml 離心管稱取500 mg火龍果果肉,加入200 μl 已加入β-巰基乙醇的Buffer RLP,研磨棒研磨至組織完全溶解,再補(bǔ)加300 μl 已加入β-巰基乙醇的Buffer RLP,使最終加入Buffer RLP的總體積為500 μl?;靹蚝?/span>13000 rpm 離心2分鐘;

*由于火龍果果肉容易破碎,本實(shí)驗(yàn)采用研磨棒磨碎果肉。

2. 吸取≤ 700 μl的離心上清到過(guò)濾柱中,離心取濾液;

3.向?yàn)V液中加入700 μl 70%乙醇,混勻后700 μl混合液加入到核酸純化柱中,離心去濾液;

4. 剩余的混合液加入到核酸純化柱中,再次離心濾液

5. 依次用500 μl Buffer WA600 μl Buffer WBR過(guò)柱洗滌;

6. 最高速離心,去除純化柱上殘留的乙醇;

7. 將核酸純化柱置于一個(gè)潔凈的RNase-free1.5 ml離心管中,用50 μl RNase-Free Water洗脫RNA

8. 在微量紫外分光光度計(jì)上測(cè)量RNA的濃度;

9. 瓊脂糖凝膠電泳。

植物總RNA提取試劑盒提取步驟:

1. 離心管稱取100 mg火龍果果肉,加入100 μl 已加入β-巰基乙醇的Buffer RLC,研磨棒研磨至組織完全溶解,,再補(bǔ)加500 μl 已加入β-巰基乙醇的Buffer RLC,使最終加入Buffer RLC的總體積為600 μl 

*由于火龍果果肉容易破碎,本實(shí)驗(yàn)采用研磨棒磨碎果肉。

2. 將組織的溶解物全部轉(zhuǎn)移到過(guò)濾柱中,離心取濾液;

3. 向?yàn)V液中加入600 μl 70%乙醇,混合后取600 μl混合液加入到核酸純化柱中,離心濾液;

4. 將剩余的混合液加入到核酸純化柱中,再次離心濾液;

5. 依次用500 μl Buffer WA600 μl Buffer WBR過(guò)柱洗滌;

6. 最高速離心,去除純化柱上殘留的乙醇;

7. 將核酸純化柱置于一個(gè)潔凈的RNase-free1.5 ml離心管中,用50 μl RNase-Free Water洗脫RNA

8. 在微量紫外分光光度計(jì)上測(cè)量RNA的濃度;

瓊脂糖凝膠電泳。

五、實(shí)驗(yàn)結(jié)果:

1. 在微量紫外分光光度計(jì)上用RNase-Free Water調(diào)零,測(cè)量洗脫下來(lái)的RNA,結(jié)果如下:


12是用植物果肉總RNA試劑盒純化獲得的總RNA;3、4是用植物總RNA提取試劑盒純化獲得的總RNA。

2. 1%的瓊脂糖凝膠上,加入5 μl提取到的RNA,電泳20 min,結(jié)果如下:


六、討論與分析

1.從結(jié)果上分析Simgen的植物果肉總RNA試劑盒和Simgen植物總RNA提取試劑盒都能提取到火龍果果肉RNA

2.Simgen植物果肉總RNA試劑盒能夠提取的樣本量植物總RNA提取試劑盒的5倍,因此提取到的RNA濃度更高。

    植物RNA的提取過(guò)程經(jīng)常是Trizol試劑使用者的噩夢(mèng),究其原因,無(wú)一例外是因?yàn)橹参锝M織中多糖(特別是淀粉類物質(zhì))衍生物的干擾:因?yàn)?/span>Trizol試劑中所含的硫氰酸胍遇到多糖類物質(zhì)便凝結(jié)成膠凍狀,阻止了RNA的進(jìn)一步釋放。當(dāng)植物組織含有大量水分(比如果肉)時(shí),就是多糖加RNA含量低的雙重阻撓了——這時(shí)候選用Simgen果肉總RNA試劑盒提取RNA確實(shí)是省時(shí)省力的好辦法。

 Simgen實(shí)驗(yàn)室